U.C.0105，夏亞叛亂的12年後——

面對實施高壓統治的地球聯邦政府，「馬法提」展開暗殺高官的方式進行抵抗。其領袖的真實身分，正是曾與阿姆羅·雷在一年戰爭中並肩作戰的布萊特之子，哈薩威・諾亞。

哈薩威因神秘少女琪琪・安達露西亞展現出的奇異力量而喚起了過去的創傷記憶。在她的言語影響下，他一邊動搖，一邊準備馬法提的行動——襲擊阿得雷德會議。